現行所有入境旅客於啟航地向航空公司報到(check in)或登機前，均應使用手機完成「入境檢疫系統(https://hdhq.mohw.gov.tw/)」線上健康申報；但仍有少數入境移工未配合，對此勞動部重申為防疫安全，請國外仲介協助移工辦理。
勞動部說明，依據中央流行疫情指揮中心109年6月24日發布事項，自109年6月29日起，所有入境旅客於啟航地向航空公司報到(check in)或登機前，均應使用手機完成「入境檢疫系統(https://hdhq.mohw.gov.tw/)」線上健康申報，以加速旅客入境通關作業及配合入境後社區防疫措施。
勞動部指出，臺灣仲介公司轉知國外仲介公司，對於需進行居家檢疫之移工(現行為產業類新聘移工)入境臺灣前，協助該移工至「入境檢疫系統」填報基本資料、旅遊史、健康聲明、臺灣居家檢疫地址及臺灣手機門號等資料；應於班機抵達前48小時內完成衛生福利部疾病管制署「入境檢疫系統」之「居家檢疫通知書線上申報」。
勞動部表示，仲介或雇主務必正確勾選-疾病管制署「入境檢疫系統」之「集中」檢疫或「居家」檢疫：如為產業類新聘移工請勾選：自宅或親友住所等或安心防疫旅館，並填寫下方地址。若是返鄉及社福類移工請勾選：集中檢疫場所即可。
另外，為配合居家檢疫追蹤，勞動部提醒，入境移工應自備可供疾病管制署定位之手機與臺灣手機門號；倘移工本人沒有臺灣手機門號，應在管制區內自費辦理，以免無法入境。
