現行法令規定，外籍移工如經確診為肺結核，必須有雇主的同意才能申請都治服務並在台治療。對此移工團體認為，此項規定嚴重違反人權，要求衛福部修改不當法令，將治療自主權還給移工。對此疾管署回應，結核病完治時間達6個月，過程需雇主配合及提供合適的環境與時間，因此移工須由雇主同意接受結核病治療的規定，是基於防疫前提，兼顧勞僱雙方權益下的考量。
台灣移工聯盟11月5日赴疾管署陳情，兩名菲籍廠工M君及J君在台工作年資都已長達6年，今年被診斷結核菌感染，雖然都有持續治療，且醫生在診斷書上註明「出院後可回復上班」、「病情改善，已無傳染性，可正常工作」，卻被雇主及仲介公司強制隔離，甚至被要求簽下自願返國同意書，讓他們覺得自己像被免洗筷般丟棄。
外國人健檢管理辦法第9條規定，受聘僱外國人確診肺結核，除多重抗藥性個案外，須檢附診斷證明書、外國人同意書以及雇主協助意願書等三項文件，申請都治服務。換言之，如果雇主不接受同意移工治療，即視為健檢不合格，將按就業服務法第73條廢聘，影響移工合法工作權益。
新竹教區移民工服務中心主任劉曉櫻表示，這兩名移工入境前的健檢合格，入境後在台工作至今6年，依規定繳納所得稅及勞、健保，僅因感染結核菌就被公司剝奪工作及受治療的權利。事實上，結核病只要規則服藥兩週，即不具有傳染力，可正常工作；持續服藥六至九個月即會痊癒。
台灣移工聯盟成員王俐婷認為，現行辦法只針對藍領移工有相關限制，白領外國人則不需經雇主同意，要求衛福部立即修改這種歧視的規定。
希望職工中心督導許惟棟則說，過去要確診才會接受都治治療，現在只要疑似個案，醫生就會建議治療，支持這樣的做法。但他強調，關鍵在於並非是移工不願接受治療，而是在現有辦法下，需要雇主同意才能進行後續療程，反而容易使治療中斷，建議開放移工在台轉換期間也能治療至找到新雇主。
對於移工團體訴求，疾管署解釋，由於結核病完治時間長達半年，因此治療過程需雇主配合，避免移工因療程中斷使病況惡化為多重抗藥性結核病。將收集各方意見及資料，邀集相關部會、專家學者與團體研商。
此外，目前除從事短期補習班教師外之第一類外國人，仍須依據職業安全衛生法相關規定進行健康檢查。疾管署說明，無論第一類或第二類外國人，一旦確診肺結核，且未進行結核病都治，均適用就業服務法第73條規定廢止聘僱許可之規定。
